密室で一人の少女が煙のように消えうせた…とはいってもそこは超能力者たちが押し込められ、不思議も秘密も盛りだくさんな第三EMP学園の女子寮でのこと。

変人科学者として名をはせる祖父の監視を両親から命じられ、祖父宅を訪れた僕―ところが祖父の姿はなく、なぜかそこに住んでいた五人の美少女たちと一緒に暮らすことになり、しかもこの世界は他次元侵略体なるものに侵略を受けているとのことで…。

突然、雨の路上に立っている自分に気づいた神田健一郎。傘も持っておらず、なぜか右手には血まみれの果物ナイフ。

超能力者ばかりが押し込まれた山奥の学校―第三EMP学園。僕は超能力を持っているわけでもないのに、なぜかここにいる。

真琴から宮野と茉衣子の“コンビ”に下された指令は―ある少女を拉致して第三EMPまで連れて来い!というもの。

突然、ごく普通の高校生(を自認している)朝凪巽のもとに現れたのは、2人の美少女。

第三EMP学園に蔓延していく“吸血鬼化現象”―。

初詣で市内の寺と神社を全制覇するだとか、ありもしない北高の七不思議だとか、涼宮ハルヒの突然の思いつきは2年に進級しても健在だが、日々麻の苗木を飛び越える忍者の如き成長を見せる俺がただ振り回されるばかりだと思うなよ。

以前、朝起きたらルームメイトが消えていた、という事件に巻き込まれた蒼ノ木類。

「ただの人間には興味ありません。この中に宇宙人、未来人、異世界人、超能力者がいたら、あたしのところに来なさい。

「世界が普通すぎる」という悩みを解消するため、涼宮ハルヒが立ち上げた謎団体SOS団。

「涼宮ハルヒ?誰のこと?」珍しく俺の真後ろの席が空席だった12月18日の昼休み。

涼宮ハルヒと出会ってから半年。

年度末のある日、生徒会長からハルヒではなく長門に下された召喚指令。

新年度第一回不思議探索パトロール後に伏せってしまった長門。

無事に進級を遂げた俺の背後席には、相変わらず涼宮ハルヒが鎮座していた。

やり残していたことをすませよう、できるだけ速やかに。

文化祭初日、底と間が抜け気味な自主製作映画上映の裏でバニー姿の涼宮ハルヒは講堂で熱唱していた。

夏休みを満喫していた俺を襲った、奇妙な違和感。その原因は朝比奈さんからの涙混じりの電話によって判明する。

“封印”された奇書。圧巻の暗黒ミステリ。

カノジョたちから「ひーくん」と呼ばれる僕の日常。